红油或麻辣锅底，适合放入油脂丰富或质地紧密的肉类，如肥牛卷、五花肉片、毛肚、黄喉、鸭肠等。这类食材在辣锅中涮煮，红油能包裹表面，增加复合香气，同时麻辣味可以中和内脏的腥膻，使口感更饱满。根茎类如土豆片、莲藕、山药，也适合放入辣锅，它们耐煮且能吸收汤汁中的香料风味。
清汤、菌汤或番茄等不辣锅底，则更适合搭配海鲜类食材，比如虾滑、鱼片、鲜虾、贝类。这些食材本身鲜味突出，在清淡汤底中短时间加热，能保留原有的清甜和嫩滑，不会被重味掩盖。各类绿叶蔬菜（如娃娃菜、茼蒿、生菜）和菌菇（金针菇、平菇、杏鲍菇）也建议放入不辣锅，煮后汤底会更加清鲜，蔬菜口感也更爽利。
豆制品和主食类需要根据具体品种来选择。冻豆腐、油豆皮、腐竹等孔隙多的豆制品，放入辣锅后会吸收汤汁，风味更浓郁；而年糕、面条、乌冬面等主食，则更适合放在不辣锅中煮熟，避免吸入过多红油导致油腻或过辣。如果喜欢喝汤，可以在不辣锅中先煮蔬菜和菌菇，汤底会变得更鲜甜，盛一碗饮用。
涮煮顺序和避免串味也值得注意。可以先在辣锅中涮一些肉类和豆制品，让辣味汤底充分释放香气；不辣锅则可以先用蔬菜和菌菇“吊”出鲜味，再涮海鲜类食材。夹过辣锅的筷子或漏勺，不宜直接伸入不辣锅中，以免辣油和花椒碎带入清汤，影响另一侧的风味纯净度。使用两套餐具分开操作，是保持两边汤底各自特点的实用方法。
涮煮时间因食材而异，辣锅因油脂多、温度较高，薄肉片通常十几秒即可变色卷曲；不辣锅温度相对温和，蔬菜和海鲜也需观察状态，虾类变红弯曲、鱼片变白即可捞出。不必拘泥于固定的时间，按食材状态灵活调整，就能让鸳鸯锅两边都物尽其用，一顿火锅吃出两种不同的风味体验。