公路运输
公路客车营运班线14857条，其中跨省班线1714条，跨区班线2567条，总营运里程271.671万公里。高速公路客运异军突起，零担和大件、集装箱货运满足了不同的运输需求。以合肥为中心，城市为枢纽，内联乡村，外联省际的客货运输网络初步形成。集装箱货运量逐年增长，大件运输生产初具规模。
自1986年以来，累计投资18791万元，建成黄山、安庆、芜湖等地市级汽车客运站14个，建成桐城、金寨、蒙城等65个县级汽车客运站，建成货运站20个和社会公用型汽车站65个。使旅客乘车环境、运输生产条件大为改善。
铁路运输
铁路线主要有京沪线、陇海线、京九线、阜淮线、宣杭线、皖赣线、宁西线、沪蓉线等。
建设西安至南京铁路，形成横贯安徽的国家东西铁路通道，根本提高安徽在铁路网中的地位。建设铜陵至九江铁路，与沿江既有断头铁路连接，构成贯穿整个长江沿岸的沿江铁路通道。动工兴建京沪高速铁路（安徽段），形成高速铁路客运专用通道，逐步实现京沪线旅客运输和货物运输分线进行，根本解决现有京沪铁路运能不足的矛盾。对既有京沪铁路（安徽段）进行电气化改造，增建津浦铁路淮河复线桥（即津浦铁路K831线路所至蚌埠站第二线），提高运输能力和效益；建设宁芜复线，配合铜九铁路贯通沿江铁路通道；建设水家湖—蚌埠复线，局部改造皖赣线和宣杭线，适应芜湖大桥开通后分流路网运量和新增运量的要求。开展黄山—金华铁路、安庆—景德镇铁路等重要铁路项目前期工作。
合肥地铁
1号线：南北方向骨干线，起点位于合肥火车站北天水路，以地下线形式沿新蚌埠路向南，经北二环路，穿过合肥火车站，沿胜利路、马鞍山路向南，至望湖中路转向西，再向南沿佳洲路直穿高铁站，之后沿青海路、庐州大道、珠江路至线路终点徽州大道站。线路全长约28.99公里，全部为地下线。全线共设车站25座，全部为地下车站。已于2009年下半年开工，预计2012年底开通运营。
2号线：东西方向骨干线，西起长江西路与长宁大道交叉口东侧，终点至长江东路与大众路交叉口西侧处。全线长27.20公里。力争2011年开工，预计2014年底开通运营。
水路运输
疏浚合肥—裕溪口航道，形成合肥通江达海的水上通道；尽快实施淮河蚌埠复线船闸工程，早日扭转现有船闸闸底过高造成的碍航、滞航状况；实施沙颍河复航工程，恢复郑州—阜阳—淮河的水路运输；建设芜太运河，形成芜湖—太湖—上海的水路运输捷径。开展引江济淮涉及航运问题的相关研究工作。改造芜湖港现有集装箱码头，增建10万TEU集装箱码头，构筑安徽省集装箱中心港；建设芜湖散装水泥专用码头，形成皖南水泥铁水联运通道；扩建、改造马鞍山港9号码头，扩大件杂货和集装箱吞吐能力；建设池州港泥州港区一期工程，形成池州港新的散货、件杂货兼集装箱作业区；改造安庆港五里庙一期工程和19号、20号码头，增加件杂货、集装箱和散货吞吐能力；建设枞阳水泥专用码头，构成江北水泥生产基地的运输配套系统；扩建铜陵港磷矿码头和硫矿码头，适应铜陵市相关工业企业发展需要。