1． 黄花菜性平、微凉、味甘，一般人群均可食用，尤其适合孕妇、产妇、正处于生长发育阶段的青少年、中老年人、工作疲劳的人及病患者食用。
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2． 新鲜黄花菜中含有秋水仙碱，秋水仙碱本身虽，但经过胃肠道的吸收，在体内氧化为“二秋水仙碱”，则具有较大的毒性，可造成胃肠道中毒症状，会使人嗓子发干、口渴，胃有烧灼感、恶心、呕吐、、腹泻，严重者还会出现血便、血尿或尿闭甚至死亡。由于鲜黄花菜的有毒成份秋水仙碱是水溶性的，且在高温60℃时可减弱或消失，因此食用时，应先将鲜黄花菜用开水焯过，再用清水浸泡2个小时以上，捞出用水洗净后再烹饪食用，这样秋水仙碱就能破坏掉，食用鲜黄花菜就安全了。但为预防鲜黄花菜中毒，每次不要多吃，每次进食量不宜超过50克，且不宜连续食用。建议将新鲜黄花菜蒸熟后晒干，若需要食用，取一部分加水泡开，再进一步烹调。
3． 食用黄花菜干制品，因为其在生产过程中已经消除了有毒成分；食用干品时，在食用前先用温水泡发（黄花菜若用冷水发制，香味不易激出；若用开水激，发出的黄花菜发艮，发成率低，故以温水浸泡为宜），然后用清水或温水进行多次浸泡清洗后再食用，这样可以去掉残留的有害物质，如二氧化硫等。
4． 调理时，黄花菜中的花蕊会溶化在汤里，因而呈现暗褐色，如果不喜欢，可以在烹煮前先将花蕊摘除。
5． 黄花菜适用于凉拌（应先焯熟）、炒、汆汤或做配料。
6． 黄花菜是近于湿热的食物，溃疡病、肠损伤、胃肠不和的人，以少吃为好；平素痰多，尤其是病者，不宜食用。
7． 患有皮肤瘙痒症者忌食。有人食用鲜黄花菜会产生过敏反应，是由于其中的花粉所致，可将黄花菜的花蕊及花粉除去，并用凉水浸泡后再炒食。